ساختمان خانه موزه آل مظفر بعنوان موزه تخصصی دانشگاه میبد، در راستای همکاری اداره میراث فرهنگی ، صنایع دستی و گردشگری با این دانشگاه ، مورد استفاده قرار می گیرد .